Diversification et adaptation génomique des virus entomopathogènes

TL;DRAbstract

A differentes echelles de temps, le but de ma these a ete de comprendre l'evolution des virus entomopathogenes a travers l’etude de la diversification et de l’adaptation genomique de grands virus a ADN d’insectes. Dans un premier temps, j’ai pu estimer les âges de diversifications des baculovirus et des nudivirus, et proposer un scenario de coevolution a long terme entre ces virus et leurs hotes insectes. Puis, me placant sur une echelle de temps moindre, j’ai montre que les hotes insectes sont le facteur principal de la diversification des baculovirus, et de facon surprenante, j’ai egalement observe que l'environnement biotique de ces virus, c’est-a-dire les plantes hotes des insectes, joue un role central dans leur evolution. Dans un second temps, des mutations ponctuelles ont pu etre reliees a l’adaptation locale de populations differentiees du baculovirus SeMNPV. Enfin, l’etude de l'adaptation genomique convergente entre les entomopoxvirus et les baculovirus a mis en evidence que l

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