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Dissertation

Influence of CpG island methylation status and histone modification marks in the firing efficiency of DNA replication origins in pluripotent cells

Ana Sofia Matos Madeira-2011-01-01-RepositóriUM (Universidade do Minho)
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TL;DRAbstract

O processo de replicação do DNA ocorre apenas uma vez em cada ciclo celular, durante a fase S, assegurando assim a duplicação precisa de todo o genoma. A replicação inicia-se em locais específicos dos cromossomas (ORIs) e ocorre num determinado intervalo de tempo. Nas células embrionárias de murganhos, as origens de replicação mais eficientes localizam-se preferencialmente em promotores que contêm ilhas CpG (CGIs), enquanto as origens pouco eficientes estão posicionadas noutros locais do genoma associadas com unidades de transcrição. Por outro lado, alguns promotores bivalentes que possuem CGIs contendo marcas de histonas activas (H3k4me3) e repressivas (H3k27me3), apresentam ORIs com diferentes eficiências. No nosso trabalho, utilizámos o método de sequenciação por Bisulfito de Sódio para analisar o estado de metilação de CGIs associadas com promotores housekeeping e bivalentes em células ES e células transformadas de murganho. Os resultados revelam que não existe uma correlação posit

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O processo de replicação do DNA ocorre apenas uma vez em cada ciclo celular, durante a fase S, assegurando assim a duplicação precisa de todo o genoma. A replicação inicia-se em locais específicos dos cromossomas (ORIs) e ocorre num determinado intervalo de tempo. Nas células embrionárias de murganhos, as origens de replicação mais eficientes localizam-se preferencialmente em promotores que contêm ilhas CpG (CGIs), enquanto as origens pouco eficientes estão posicionadas noutros locais do genoma associadas com unidades de transcrição. Por outro lado, alguns promotores bivalentes que possuem CGIs contendo marcas de histonas activas (H3k4me3) e repressivas (H3k27me3), apresentam ORIs com diferentes eficiências. No nosso trabalho, utilizámos o método de sequenciação por Bisulfito de Sódio para analisar o estado de metilação de CGIs associadas com promotores housekeeping e bivalentes em células ES e células transformadas de murganho. Os resultados revelam que não existe uma correlação posit

Keywords

BiologyCpG siteDNA methylationHistoneGeneticsCell biologyDNAGene

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