Pseudomonas syringae pv. syringae által termelt lipopeptidek és a sejtmembrán közötti kölcsönhatások vizsgálata = Investigation of lipopeptides and cell membrane interactions

TL;DRAbstract

Az OTKA projekt keretében három, különböző szerkezetű és biológiai aktivitású, antifungális ciklusos lipodepsipeptid, a syringomycin-E (SR-E), a syringotoxin (ST-B) és a syringopeptin-25A (SP-25A) vegyület, hatásmechanizmusát vizsgáltuk atomi szintű molekula dinamikai (MD) szimulációval. A projekt első két évében a három CLP molekula hidrofil és hidrofób közegben kialakuló háromdimenziós (3D) szerkezetét határoztuk meg. Eredményeink összhangban vannak az irodalomból ismert kísérleti megállapításokkal, amelyeket két közleményben foglaltunk össze. Az MD számolások eredményeként meghatározott és jellemzett konformereket építettük be a sejt membránt modellező, különböző típusú és összetételű lipid kettősrétegekbe, amelyeket a projekt harmadik évében építettünk fel. A kettősrétegek megszerkesztése önmagában nem leközölhető eredmény, azonban várhatóan egy lipid adatbázisba bekerülve mások által is alkalmazhatóvá válhatnak. A projekt negyedik évében az összeépített, különböző összetételű és m

Chat with Paper

AI Agents for this Paper