北京市同性恋HIV—1感染者的包膜基因C2—V3区序列测定和亚型分析

TL;DRAbstract

目的了解北京市同性恋HIV-1感染者HIV-1的亚型类型及传播来源和流行时间.方法应用套式聚合酶链式反应(PCR)对12份1993～2001年北京市HIV-1阳性同性恋者外周血单个核细胞(PBMC)的核酸样品进行扩增,并对其包膜区的C2-V3段的306个核酸序列进行测定和分析.结果 12份样品全部是B亚型的HIV-1毒株序列,其亚型内的基因离散率为10.35±2.06,与国际A-E亚型共享序列比较后发现其与A、C、D、E亚型的共享序列的基因离散率均大于25%,而与国际B亚型共享序列的基因离散率仅为11.25±3.60.系统树分析显示,12个毒株与B亚型共享序列聚在一起并远离其它国际亚型,并且12个毒株与SF162 紧密相连,而与国际B亚型共享序列和泰国B亚型代表株TH14可以分开.对gp120中最重要的中和抗体决定簇V3环序列进行对比分析发现,12毒株在V3环中变化较大,其中4毒株带有GPGR这一欧美B亚型V3环顶端四肽序列特征,占33.33%,1个毒株带有GLGR,占8.33%,而其它7个毒株为GWGR,占58.34%.结论 HIV-1 在北京市同性恋人群中流行的为B亚型,流行来源为欧美,流行时间10年左右,V3 环顶端四肽序列特征以 GWGR 为主.

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