Did myriapods evolve from a single common ancestor?
TL;DRAbstract
Die vorliegende Arbeit soll die Verwendbarkeit der ribosomalen RNA 28S zur Rekonstruktion der Myriapodenphylogenie hinsichtlich der Stellung innerhalb der Euarthropoda sowie der Verwandtschaftsbeziehungen zwischen den vier Myriapodengruppen bewerten. Diese Studie basiert auf 26 Myriapodensequenzen von denen sechs neu amplifiziert und sequenziert wurden. Zusätzlich wurden insgesamt 16 Sequenzen von Vertretern der Hexapoda, Crustacea und Chelicerata, sowie Milnesium tardigradum (Tardigrada) verwendet. Neben der manuellen Alinierungsstrategie wurden zusätzlich eine vollständig automatisierte Alinierungs- und Merkmalsauswahlmethode (RNAsalsa und ALISCORE) auf ihre Eignung für die Euarthropodenphylogenie mittels 28S rRNA getestet. Als Methoden zur Baumrekonstruktion wurden Maximum Parsimony, Maximum Likelihood und Bayesian inference verwendet. Darüber hinaus wurde eine Bayesian Analyse durchgeführt, welche die Abhängigkeit von Basensubstitutionen in gepaarten Bereichen innerhalb der rRNA (s
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Die vorliegende Arbeit soll die Verwendbarkeit der ribosomalen RNA 28S zur Rekonstruktion der Myriapodenphylogenie hinsichtlich der Stellung innerhalb der Euarthropoda sowie der Verwandtschaftsbeziehungen zwischen den vier Myriapodengruppen bewerten. Diese Studie basiert auf 26 Myriapodensequenzen von denen sechs neu amplifiziert und sequenziert wurden. Zusätzlich wurden insgesamt 16 Sequenzen von Vertretern der Hexapoda, Crustacea und Chelicerata, sowie Milnesium tardigradum (Tardigrada) verwendet. Neben der manuellen Alinierungsstrategie wurden zusätzlich eine vollständig automatisierte Alinierungs- und Merkmalsauswahlmethode (RNAsalsa und ALISCORE) auf ihre Eignung für die Euarthropodenphylogenie mittels 28S rRNA getestet. Als Methoden zur Baumrekonstruktion wurden Maximum Parsimony, Maximum Likelihood und Bayesian inference verwendet. Darüber hinaus wurde eine Bayesian Analyse durchgeführt, welche die Abhängigkeit von Basensubstitutionen in gepaarten Bereichen innerhalb der rRNA (s
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